Mendohet se, arrestimi është bërë me urdhër të prokurorisë së Prokurorisë së Krimeve të Rënda dhe sipas burimeve të ndryshme saktësohet, se policia ka hezituar në kryerjen e detyrës së saj. Pas ndalimit, Skeja është shoqëruar në mjediset e Drejtorisë së Policisë në Tiranë, ndërkohë që po të njëjtat burime saktësojnë se, ka presione për ta gjykuar atë në gjendje të lirë.
Emri i Fatos Skejës, ka dalë në skenë në një moment shumë të rëndësishëm, menjëherë pas vrasjeve në bulevard të 21 janarit. Familjarët e Hekuran Dedës, njërit prej viktimave të 21 janarit, e denoncuan dhe e akuzuan publikisht atë, pasi u kishte ofruar një shumë parash në këmbim të pranimit të Berishës në shtëpi për një kafe duke u premtuar, se do t’u jepte informacione si edhe një foto të vrasësit të familjarit të tyre.
Në mbrojtje të gjithë zinxhirit komandues të gardës dhe të implikuarve në këtë çështje të bujshme nga ana e kreut të ish qeveriseë Sali Berisha, vjen dhe mbrojtja e Fatos Skejës, ku pavarësisht denoncimit publik, Skeja nuk u ndalua asnjëherë, përkundrazi, vëllai i Hekuran Dedës u dënua me gjobë për shpifje, pas një procesi që Skeja hapi kundër familjes Deda.